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三內丸山遺跡為約5500年前至4000年前日本最大規模的村落遺跡。在1992年開始的挖掘調查當中，挖掘出大量的立穴式居住遺跡、高架式建築遺跡，以及需要高加工技術的漆器、翡翠等，改變了以往大眾對於繩文文化的印象。
了解遺跡重要性後，青森縣於西元1994年決定將其保留，並於西元2000年11月登錄為國家特別歷史遺跡。

讓繩文遺跡群成為世界遺產

包含青森縣內的三內丸山遺跡、秋田縣內的特別歷史遺跡大湯環狀列石等，由北海道至北東北留存著許多繩文文化遺跡。這些以北海道及北東北為中心的繩文遺跡群，都以登錄成世界遺產並永久流傳為目標。

學習繩文文化

位於遺跡旁設有展示出土物的繩文時遊館，以及製作繩文時代裝飾物的體驗教室等。另外遺跡內也派駐有英文解說導覽員(需預約)。